邓本元的生涯始于1987年1月，那时他从上海交通大学毕业后，开始了他的职业生涯。他在福建省经济研究中心、省台办、省政府办公厅、省委办公厅和省委政策研究室等多个部门工作，积累了丰富的经验。1995年7月，他晋升为正处级职务，正式步入了高级管理层。
在1998年4月，邓本元担任了福建省委办公厅副主任，同时是厅务会议成员。其间，他参加了福建省委党校的地厅级干部进修班，并在2002年3月至7月期间，在中央党校进修二班深造。同时，他还担任了陈明义秘书，直到2000年12月。
2003年12月，邓本元的职务进一步提升为福建省委副秘书长，依旧是厅务会议成员。次年1月，他兼任了省委政策研究室副主任。2005年6月，他转任中共福建省委台湾工作办公室、省政府台湾事务办公室主任，处理对台事务。
2011年7月19日，邓本元成为福建省三明市的副书记，仅一周后，他被任命为三明市委副书记并代理市长。在2012年1月，他被三明市第十二届人民代表大会第一次会议正式选为市长。邓本元作为福建省委委员，也是第十一届全国人大代表，体现了他在国家和地方政治领域的影响力。
根据地方组织法的规定，邓本元在2011年7月27日的三明市第十一届人民代表大会常务委员会第三十四次会议上，被代理三明市人民政府市长职务。这一任命体现了对他能力和经验的认可。
2013年2月7日，邓本元同志被省委任命为中共三明市委书记，这一职务的晋升标志着他在福建省政治领导层中的重要角色进一步加强。
邓本元，1963年6月出生，研究生学历，工学硕士。1987年从上海交通大学毕业后，先后在福建省经济研究中心、省台办、省政府办公厅、省委办公厅、省委政策研究室工作，2005年6月起担任福建省台办主任。
