神舟十三号航天员返回后需经历医学隔离期、医学疗养期和恢复疗养期三个阶段，重点进行医学检查和身体恢复，总时长约3至4个月。航天员返回地球着陆后，首先在着陆场接受初步医学检查，对健康状况做出基本判断。随后进入隔离程序，由专门医疗团队全程监测身体状况。1. 医学隔离期（约14天）航天员在航天员公寓内适应地球重力环境，重点提高心血管系统和支持运动器官功能，改善立位耐力，消除飞行后疲劳。此阶段与外界基本隔绝，接受全面医学检查和健康评估，项目涉及临床各科，特别关注心肺脑功能，以及立位耐力下降、平衡功能、肌肉萎缩等太空任务引发的生理变化。2. 医学疗养期（约20-30天）继续恢复身体状态，通过专业疗养手段进一步调理生理机能。3. 恢复疗养期（约3个月）如身体恢复良好，航天员可逐步回归日常训练。整个恢复过程包含18类康复项目，除常规医学手段外，还采用穴位点按、针灸推拿、中药浴、熏蒸等中国传统特色疗法，并利用水中跑台等设备进行减重训练。隔离的主要原因是太空高强度辐射可能影响人体基因，需通过严密监测确保航天员长期健康安全。
