《卿卿日常》大结局是一个全员圆满的大团圆结局。
尹峥与李薇这条主线，尹峥通过新川主考验，代理朝政后正式被传位成为新川之主，随后与李薇举行大婚。在中秋节尹峥生日时，李薇告知尹峥自己怀孕的喜讯。
在女性成长方面，李薇对内苑学堂进行改革，将九川和亲改为女官选拔，推动女性入仕创业；元英实现了成为女官的梦想；郝葭独立创业，经济上无忧无虑；上官婧与尹歧和解，计划一起游历九川。
其他角色也各有归宿。老四尹峻被重用为九川事务司之主，他的妻子安曦元因长孙得以被保下；三少主尹岸成了“妻管严”，全力支持节气姑娘们的事业；新川主选择半隐退养老，和夫人们相处和睦；老七与阮思思感情稳定；九少主因联姻改革而开心；十少主则为找不到老婆而苦恼。
结局场景温馨，众人齐聚静园为尹峥庆生过中秋，并约定每年此时都要团聚。并且剧版结局与原著有很大差异，原著《清穿日常》中李薇结局压抑，沦为生育工具，而剧版改为架空背景，强化了女性独立，让尹峥掌权、李薇实现理想，整体风格更温暖治愈。
