《少年派》大结局是钱三一考入清华，邓小琪考入中戏，林妙妙考入江州大学；高考当天林妙妙弟弟出生；去北京的火车上钱三一承认喜欢林妙妙但未表白。 具体情节如下：
离别场景与情感暗涌钱三一和邓小琪即将前往北京，父母与林妙妙、江天昊一同送行。钱三一特意叮嘱江天昊照顾好林妙妙，检票进站时，江天昊和林妙妙望着他们的背影，心中泛起苦涩与不舍。
未说出口的告白在去北京的火车上，钱三一整理了林妙妙可以报考的北京高校名单。邓小琪追问为何不表白，钱三一叹息道：“别人都看出来了，可为什么林妙妙什么都不知道呢？” 暗示他早已察觉林妙妙未察觉自己的心意。
四人组的遗憾与成长林妙妙与江天昊走在回家路上，回忆起四人共度的时光，感慨那是最美好的岁月。尽管钱三一未表白，但四人组在离别中学会了珍惜当下，各自迈向人生新阶段。
