伊朗与以色列冲突的主要原因是宗教对立、核问题、代理人战争、地盘争夺、美国介入及直接冲突引爆点等多重因素共同作用的结果。
宗教对立是两国敌对的核心根源之一。伊朗以什叶派伊斯兰教为国教，而以色列是犹太教国家。1979年伊朗伊斯兰革命后，霍梅尼政权将以色列定性为“西方插在中东的钉子”和“小撒旦”，公开宣称要“消灭以色列”；以色列则视伊朗为“支持恐怖主义的头号国家”。这种宗教意识形态的尖锐对立，使两国从革命前的盟友（巴列维王朝时期以色列曾帮助伊朗培训安全部队）彻底转变为死敌。
核问题是直接冲突的导火索。以色列认为伊朗的核计划威胁其生存，多次指控伊朗浓缩铀储量已接近武器级水平。2024年4月和10月，以色列通过秘密轰炸破坏伊朗核设施；2025年6月，以色列更是发动大规模空袭，试图彻底摧毁伊朗核能力。伊朗则坚持核计划用于和平目的，但国际原子能机构2025年6月12日报告指出伊朗未履行核义务，为以色列动武提供了借口。
代理人战争是两国间接对抗的主要形式。伊朗通过支持黎巴嫩真主党、也门胡塞武装、叙利亚政府军及巴勒斯坦哈马斯等组织，构建“抵抗轴心”对抗以色列；以色列则通过空袭叙利亚境内伊朗军事目标、支持反伊朗武装等方式反击。例如，2023年10月哈马斯袭击以色列后，以色列直接打击加沙地带，伊朗随即向真主党输送火箭弹，形成连锁反应。
地盘争夺体现在中东地区影响力与资源控制上。伊朗试图通过“抵抗轴心”扩大什叶派势力范围，挑战以色列的地中海霸权；以色列则联合美国等盟友遏制伊朗扩张。双方围绕霍尔木兹海峡（全球20%石油运输通道）的争夺尤为激烈，伊朗曾多次威胁封锁海峡，以色列则通过军事威慑维护航道安全。
美国介入进一步激化了矛盾。作为以色列的坚定盟友，美国在特朗普政府退出伊核协议后，为以色列提供了更多军事支持与情报共享。2025年6月空袭前，美国与以色列的情报合作被伊朗指责为“双标”行为，而美国反诬伊朗“支持恐怖主义”，使冲突升级为大国博弈的延伸。
