金圣柱公开的情史极为低调，唯一被证实并由本人承认的是与一位内地制片人的婚姻关系，两人于2018年前后结婚，同年迎来儿子出生。这段关系长期未对外公开，直至2024年2月17日生日直播中，队友李汶翰一句“你儿子现在都没睡觉吗？快来让叔叔抱抱”意外曝光，引发全网热议。3月2日起，金圣柱陆续在微博、IG发布中韩双语声明，坦承已婚生子，并向粉丝致歉与致谢。他强调当初选择隐婚是为给家庭营造平静安全的成长环境，并非刻意隐瞒，而是出于对家人隐私的保护。网络早有零星传闻称其2018年已当爸，但始终未获证实；另有消息指其妻子为业内制片人，二人因工作结缘，感情稳定，婚后保持低调度日。除该段婚姻外，金圣柱从未公开承认或被实锤其他恋爱关系，早年与林心如、宋江、金亚中等合作演员均属正常职场互动，无绯闻佐证。他在综艺《花样男团》中与郭德纲结下忘年交，认其为干爹，亦属师徒情谊范畴。粉丝普遍尊重其私人选择，UNIQ成员李汶翰、周艺轩、王一博等也多次以轻松温暖方式表达支持，展现团队长久默契与信任。
