东方网有消息报道：上海海洋大学研发的$1.1$万米载人潜水器，获得了上海市科委立项支持，这一深度已可抵达目前地球所知的最深的海沟$-$马里亚纳海沟。这意味着中国载人潜水器将在全世界近$100\%$的海洋范围内自由行动。如图所示为潜水器在某次实验中下潜的速度一时间图象，规定向下为速度的正方向，则（ ）A.$3s$末潜水器的加速度为零B.$ 0\sim 1s$内潜水器的加速度小于$3s-5s$内的加速度C.$ 5s$末，潜水器回到出发点D.$ 5s$末，潜水器离出发点最远

$A$、$3s$末潜水器的速度为零，加速度不为零，故$A$错误。

$B$、$0\sim 1s$内加速度$a_{1}=\dfrac{\triangle v}{\triangle t}=\dfrac{3}{1}m/s^{2}=3m/s^{2}$，$3s-5s$内的加速度$a_{2}=\dfrac{\triangle v}{\triangle t}=\dfrac{-6-0}{5-3}m/s^{2}=-3m/s^{2}.0\sim 1s$内潜水器的加速度大小等于$3s-5s$内的加速度大小，故$B$错误。

$C$、图象的面积表示位移，$5s$末的位移$S=\dfrac{1}{2}\times \left(1+3\right)\times 3m-\dfrac{1}{2}\times 2\times 6m=0$，潜水器回到出发点。故$C$正确。

$D$、$3s$末，潜水器离出发点最远。故$D$错误。

故选：$C$。