乌干达疟疾流行最严重的地区集中在北部、西尼罗河及东部区域，最新数据显示以下高危区域：1. 北部地区 基特古姆（Kitgum）、古卢（Gulu）等地的疟疾传播率持续居高，2019年研究显示当地居民年均可能遭遇1500次感染性叮咬。2023年监测数据表明，这些区域仍是全国疟疾负担最重的地区之一。2. 西尼罗河地区 2020-2023年病例数长期占全国17%以上，2021年发病率达473例/千人，2023年仍为病例数最高区域。3. 阿乔利地区（Acholi） 2020年发病率峰值735例/千人，2023年降至570例/千人，但仍是核心流行区。4. 布索加（Busoga）与兰戈（Lango） 与西尼罗河、阿乔利共同构成全国51%的病例来源。2022年数据显示，卡拉莫贾和特索地区单周感染率超55%。 注：所有数据均来自乌干达卫生部2020-2023年疟疾监测报告，为目前公开的最新权威统计。
